1º Presidente: AFONSO MANOEL BORGES FERREIRA (1993-1995)
2º Presidente: CARLOS TADEU PINHEIRO GASPAR (1995-1997)
3º Presidente: GENIVAL CAETANO DE AQUINO (1997-2001)
4º Presidente: OSWALDO DOS SANTOS MARINHO (2001-2005)
5º Presidente: ALBERTO NOGUEIRA DA CRUZ (2005 a 2014)
A FCDL/MA possui uma administração descentralizada, com a participação de todas as Câmaras associadas, que periodicamente se reúnem para a deliberação das mais importantes questões do movimento lojista maranhense.